Jaké je taxonomické uspořádání sinic řádu Synechococcales?
Bakterie s fotosyntézou, během které vzniká kyslík, čili sinice, přestavují nesmírně, přímo životně důležitou skupinu mikroorganismů, kterým vděčíme za kyslíkatou atmosféru naší planety. Pokud jde o taxonomii sinic, odborníci je dříve členili především podle morfologických znaků, zatímco dnes je jejich taxonomické uspořádání založeno hlavně na sekvencích nukleových kyselin. V současnosti jsou sinice rozděleny do 8 řádů, v nichž je celkem 300 rodů, z toho 50 nově popsaných po roce 2000. Navzdory rychle přibývajícímu počtu nových druhů a rodů sinic se věnuje méně pozornosti taxonomii této skupiny na úrovni čeledí.
Jeffrey R. Johansen, který působí na Přírodovědecké fakultě Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích, a také na americké Univerzitě Johna Carolla v Ohiu, společně s mezinárodním týmem kolegů zpracoval taxonomii vláknitých sinic řádu Synechococcales. Studovali celkem 48 kmenů těchto sinic a využívali k tomu sekvence pro ribozomální 16S rRNA, a také genu rpoC1, který je součástí komplexního enzymu RNA polymerázy. Vedle sekvencí sinici analyzovali i jejich morfologické znaky.
Výsledkem fylogenetických analýz je rozčlenění řádu Synechococcales do čtyř čeledí. Jsou to dvě stávající čeledi, Leptolyngbyaceae a Prochlorotrichaceae, společně se dvěma nově zavedenými čeleděmi, Oculatellaceae a Trichocoleaceae. Čeledi Oculatellaceae se badatelé věnovali detailněji a popsali v ní šest nových rodů: Pegethrix, Drouetiella, Cartusia, Tildeniella, Komarkovaea, Kaiparowitsia, Timaviella, s celkem 14 novými druhy.
Kontakt: Jeffrey R. Johansen, Ph.D. (johansen at jcu.cz)
